人工智能仍然无法解决的五个蛋白设计挑战

Rosetta和AlphaFold等工具重新定义了蛋白质工程领域。但目前仍有一些问题无法解决。

德国慕尼黑路德维希马克西米利安大学（Ludwig Maximilian University）的生物物理化学家Alena Khmelinskaia渴望将定制蛋白质的过程变得如同点餐一样便捷。她设想了一种自动售货机，研究人员可以通过它来定制蛋白质的功能、大小、位置、伙伴等特性。Khmelinskaia表示，理想情况下，你会得到一个完美的设计，可以同时满足这些需求。

就目前而言，这还遥不可及。但计算蛋白质设计和机器学习的发展已经让这个梦想比以往任何时候都更加触手可及。

在几年前，研究人员产生想要的蛋白质的方式是：将蛋白质克隆到细菌或酵母中，并诱导微生物突变，直到它们产生所需的产品。科学家也可以通过故意改变其氨基酸序列来手动设计蛋白质，但这是一个费力的过程，可能会导致蛋白质折叠错误或阻止细胞产生蛋白质。